Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CYTH1Q15438 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms