Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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