Protein–RNA interactions for Protein: Q13231

CHIT1, Chitotriosidase-1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIT1Q13231 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms