Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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