Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms