Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms