Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HBBP68871 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HBBP68871 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms