Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms