Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PGGT1BP53609 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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PGGT1BP53609 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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PGGT1BP53609 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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