Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGM4P49221 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TGM4P49221 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms