Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD1P28340 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms