Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YY1P25490 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
YY1P25490 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
YY1P25490 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
YY1P25490 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
YY1P25490 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
YY1P25490 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YY1P25490 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YY1P25490 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YY1P25490 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YY1P25490 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YY1P25490 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YY1P25490 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YY1P25490 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YY1P25490 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms