Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPREP23469 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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PTPREP23469 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPREP23469 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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