Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms