Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEFHP12036 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEFHP12036 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEFHP12036 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEFHP12036 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEFHP12036 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEFHP12036 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEFHP12036 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms