Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IQCE-209ENST00000427817 580 ntTSL 38.65□□□□□ -1.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HERC2P3-209ENST00000437318 4161 ntTSL 1 (best)8.62□□□□□ -1.038e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 YTHDF2-204ENST00000475796 358 ntTSL 28.6□□□□□ -1.038e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EXOC7-220ENST00000607838 3353 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.038e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.033e-7■■■■■ 107
SF3B1O75533 GLCCI1-209ENST00000489405 1475 ntTSL 58.58□□□□□ -1.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BMS1P8-201ENST00000565049 1178 ntBASIC8.57□□□□□ -1.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EPB41L1-201ENST00000202028 3514 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CD44-211ENST00000442151 1825 ntTSL 1 (best)8.57□□□□□ -1.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CASP8-204ENST00000339403 1723 ntTSL 1 (best)8.57□□□□□ -1.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZRANB2-AS2-236ENST00000630926 695 ntTSL 58.54□□□□□ -1.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.058e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PBRM1-209ENST00000412587 4766 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.058e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.051e-10■■■■■ 107
SF3B1O75533 ADTRP-206ENST00000505099 687 ntTSL 38.5□□□□□ -1.058e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.058e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KIF1BP-202ENST00000481912 397 ntTSL 38.49□□□□□ -1.058e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.058e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.058e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CD44-205ENST00000352818 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.058e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.058e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ELP6-213ENST00000483205 553 ntTSL 28.47□□□□□ -1.058e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CD44-208ENST00000428726 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.058e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NCALD-221ENST00000522206 585 ntTSL 48.46□□□□□ -1.061e-10■■■■■ 107
SF3B1O75533 PPM1H-205ENST00000551519 584 ntTSL 48.45□□□□□ -1.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC093297.2-201ENST00000503452 738 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SMURF2-202ENST00000578200 339 ntTSL 58.43□□□□□ -1.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 WDR59-219ENST00000569549 934 ntTSL 58.42□□□□□ -1.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AKT2-215ENST00000476247 488 ntTSL 38.41□□□□□ -1.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 107
SF3B1O75533 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C2CD5-218ENST00000545552 3471 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CASP8-208ENST00000392266 1283 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TRDMT1-210ENST00000488990 1301 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HEXA-213ENST00000568777 6909 ntTSL 58.33□□□□□ -1.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FAM136A-206ENST00000498665 561 ntTSL 28.32□□□□□ -1.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CD33-205ENST00000598473 4728 ntTSL 28.32□□□□□ -1.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KLHDC4-219ENST00000567513 585 ntTSL 48.31□□□□□ -1.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SNAP23-220ENST00000568841 632 ntTSL 38.3□□□□□ -1.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RRM2-207ENST00000485717 573 ntTSL 1 (best)8.29□□□□□ -1.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.098e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GAS2-203ENST00000524701 2241 ntTSL 28.25□□□□□ -1.098e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SCAPER-221ENST00000568549 625 ntTSL 58.25□□□□□ -1.098e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CALB1-209ENST00000520613 548 ntTSL 58.24□□□□□ -1.098e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.098e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TRIM44-202ENST00000532066 637 ntTSL 48.22□□□□□ -1.098e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-206ENST00000503075 773 ntTSL 58.21□□□□□ -1.18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC007040.2-202ENST00000453130 423 ntTSL 38.18□□□□□ -1.18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 107
SF3B1O75533 FYN-225ENST00000523322 909 ntTSL 38.16□□□□□ -1.18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.19e-8■■■■■ 107
SF3B1O75533 AVIL-207ENST00000549994 568 ntTSL 48.15□□□□□ -1.18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-222ENST00000514028 3393 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.118e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CALB1-207ENST00000514406 561 ntTSL 58.14□□□□□ -1.118e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.118e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 OFCC1-211ENST00000485268 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.12□□□□□ -1.118e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-216ENST00000474783 4392 ntTSL 58.12□□□□□ -1.118e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RNF213-203ENST00000427003 3552 ntTSL 1 (best)8.12□□□□□ -1.118e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.118e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.118e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LINC00963-218ENST00000624138 261 ntTSL 58.09□□□□□ -1.118e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CCZ1B-212ENST00000490178 527 ntTSL 58.09□□□□□ -1.118e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AF279873.3-204ENST00000523336 784 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.128e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SNTB2-206ENST00000528525 448 ntTSL 38.06□□□□□ -1.128e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.128e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.129e-8■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZDHHC2-203ENST00000522184 487 ntTSL 38.04□□□□□ -1.128e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PIP5K1B-202ENST00000377284 612 ntTSL 38.04□□□□□ -1.128e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DEAF1-211ENST00000529727 248 ntTSL 38.04□□□□□ -1.128e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RTTN-212ENST00000638298 892 ntTSL 58.03□□□□□ -1.128e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAD51-206ENST00000527860 566 ntTSL 48.01□□□□□ -1.138e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.139e-8■■■■■ 107
SF3B1O75533 YTHDF2-205ENST00000476976 657 ntTSL 37.95□□□□□ -1.148e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RTTN-223ENST00000640931 2065 ntTSL 57.93□□□□□ -1.148e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.149e-8■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC25A43-202ENST00000484058 358 ntTSL 27.93□□□□□ -1.148e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 107
SF3B1O75533 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.148e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.148e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TRIM66-203ENST00000481014 6505 ntTSL 27.91□□□□□ -1.148e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 USP4-211ENST00000485450 3541 ntTSL 27.9□□□□□ -1.158e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TTLL7-213ENST00000488014 7949 ntTSL 1 (best)7.89□□□□□ -1.158e-6■■■■■ 107
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