Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
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PRAMEF10O60809 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PRAMEF10O60809 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PRAMEF10O60809 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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