Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms