Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms