Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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