Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CLDN25C9JDP6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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CLDN25C9JDP6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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