Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOBPA7XYQ1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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