Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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