Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYTH4Q9UIA0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms