Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms