Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS1Q9NYS0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms