Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms