Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms