Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PMCHL2Q9BQD1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms