Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SPOCK3Q9BQ16 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SPOCK3Q9BQ16 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SPOCK3Q9BQ16 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SPOCK3Q9BQ16 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SPOCK3Q9BQ16 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SPOCK3Q9BQ16 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SPOCK3Q9BQ16 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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SPOCK3Q9BQ16 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPOCK3Q9BQ16 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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