Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms