Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCL2Q8N4E4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms