Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLD3Q8IV08 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms