Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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