Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms