Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TYW3Q6IPR3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYW3Q6IPR3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms