Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMB2

TTLL5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL5Q6EMB2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTLL5Q6EMB2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms