Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms