Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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