Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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