Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms