Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms