Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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