Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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