Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PMS2P11Q13670 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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