Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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