Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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