Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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AP3B2Q13367 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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AP3B2Q13367 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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AP3B2Q13367 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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AP3B2Q13367 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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AP3B2Q13367 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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