Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms