Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms